Cette église se dresse en bordure du cami Romieu ou chemin des pélérins chemin utilisé durant tout le Moyen Age,et qui était une des principales routes du Languedoc méditerranéen
Ce chemin de pèlerinage faisait de Loupian une étape pour les voyageurs qui y trouvaient plusieurs auberges et une maladrerie appartenant à un lépreux qui l'exploitait et qui dépendait des consuls . Malgré l'opposition des consuls, cette maladrerie fut attribuée en 1674 à l'ordre de Saint-Lazare.
L'église gothique fut donc proportionnée de manière à pouvoir accueillir les pèlerins en même temps que la communauté villageoise.
Elle fut construite à l extérieur du village car on trouve un lieu de culte, préexistant . En effet des vestiges d'une église paléochrétienne se trouve tout à coté out à côté qui fut abandonné à la fin du VIe siècle Ap JC après une occupation de100/200 ans environ
Elle est de style gothique languedocien avec nef large et unique, constituée de cinq travées, et contreforts très saillants formant murs boutants. Ce plan découle généralement des nécessités de défense qui s'imposaient dans la région, mais la maçonnerie ne présente aucune trace apparente d'ouvrages militaires.
Elle fut construite dans le courant du XIVe siècle Toutefois une charte de 1099 mentionne une église Sainte-Cécile à Loupian parmi les possessions de l'abbaye de Psalmodi( près d'Aigues Mortes ). L'église actuelle ne présente aucun vestige permettant de constater si elle a été bâtie sur l'emplacement de celle qui portait le même vocable au 11e siècle. Elle
Elle est orientée Est /Ouest et elle est austère et ressemble à une forteresse Ses murs extérieurs sont de murs-boutants, et elle ne possède pas de clocher seul un modeste clocheton. elle possède 2 portails avec redents moulurés de profils similaires à ceux de l'intérieur

Le portail principal, s'ouvrant sur la façade Occidentale,dans la xe de la nef avec une grande rosace , la porte latérale, dite Porte des Morts car elle ouvrait directement sur le cimetière,

Ces ouvertures ne sont pas décorées hormis chapiteaux feuillagés très simples. L'intérieur ne possède pas de déambulatoire et de chapelles latérales.
Une travée sur deux est aveugle et les fenêtres, lorsqu’il y en a, sont étroites et placées très haut sur les murs..La décoration se trouve, elle aussi, réduite à sa plus simple expression et la sculpture est totalement absente, en dehors des armoiries gravées sur les clefs de voûte.
Dans l'angle sud-ouest du bâtiment, un escalier à vis se développe dans une petite tour qui relie les deux contreforts d'angle et donne accès à la toiture.